Bo3gyX

Для каждого сайта у вас должен быть отдельный конфиг в папке sites-enabled
например site1.conf, site2.conf, site3.conf
в каждом таком конфиге для каждого сайта должен быть указан домен сайта:
server_name site1.ru www.site1.ru;
и путь до корня root /home/web/site1.ru;
Подключение суперкеша закомментируйте на время настройки. Как только все сайты будут настроены и будут работать подключите конфиг суперкеша.

Корзина должна выводится либо шорт-кодом [woocommerce_cart] размещенным на странице корзины https://i.imgur.com/HTF8lo7.png
либо через гуттенберг верстку, если тема блочная.

Простого способа скрыть часть атрибутов товара при выводе нет.
Потенциально это можно сделать так:
Данные атрибутов выводятся в шаблон через json в дата параметр формы https://i.imgur.com/WaOkItY.png,
там на их основе js рендерит поля. Вы можете изменить выводимый json убрав лишние данные.
Но могут возникнуть проблемы в других частях кода, например в корзине, т.к. при обработке будет сопоставление по всем атрибутам.
Не знаю зачем вам это, но лучшим решением будет либо полностью удалить все лишние атрибуты( вариации), либо выставить для них дефолтное значение "нет опции" и скрыть поле через css, что бы клиент не мог выбрать другое значение.

Скорее всего у вас настройки некорректно стоят какие-то.
Полилэнг работает через связь таксономий, попробуйте удалить языки создать заново по документации.

Втроенной функции нет, ибо незачем.
Если очень надо можете через замену в строке удалить, как то так будет выглядеть:

str_replace(get_site_url(), '', get_template_directory_uri());

1) Проверьте подключается ли jquery, если нет попробуйте удалить строки с заменой
2) Попробуйте подключить 2й скрипт убрав зависимость от jquery.
3) Проверьте в косоле, что нет ошибки правильности пути

Кому интересно, вот готовое решение https://woo2iiko.rwsite.ru/