.wrapper>.black+.red+.blue.wrapper{position: relative;}
.blue{position:absolute}$(".cat1").css("background-color", changelogTotals_colors[0]);$(".popupcontent").append(" <div class=\"changelogCategory cat1\">текст</div>\n" +"); еще раз вызовите $(".cat1").css("background-color", changelogTotals_colors[0]); либо используйте дилегерирование.