Арслан Алиев

Woocommerce это плагин к Wordpress, который в свою очередь блоговый движок.
Magento - это платформа для e-Commerce.

тут не из чего выбирать.

Работаю с magento с 2014 года, переехали на нее с opencart. Первое время было очень сложно, так как логика работы иная. Для стандартного ИМ в коробке есть всё. Нормальный платёжный модуль есть от Монета.ру, доставку почтой легко можно организовать штатными средствами, но лучше сразу поставить MatrixRate Table Rate Shipping с помощью данного модуля можно сделать и курьерки, естественно без синхронизации с личными кабинетами перевозчиков, чего на первое время просто достаточно. Собственно для того чтобы запустится и начать получать доход вложений, кроме собственного времени ничего не нужно.
Настройка не из лёгких.
О нагрузке нельзя говорить не зная количества посетителей, структуру каталогов/фильтров и прочего, но любое решение можно оптимизировать хард или софт средствами.
К стабильности нет никаких претензий, но опять же это при правильной настройке, в сети встречаются люди которые даже установить не могут. Magento наверное вообще самый стабильный и защищённый движок, что не скажешь о втором.
Кстати ни то не другое не является cms, Magento скорее фреймворк для электронной коммерции с огромными возможностями, второй просто прослойка для убогого вордпресса