Ранее просто ставил Linux (Ubuntu) на отдельный логический раздел, после чего GRUB "подхватывал" винду и свободного её загружал при выборе ОС. А когда захотел снести Ubuntu, просто восстановил загрузчик через винду.
Особых проблем не было, кроме мелочей со свободными видеодрайверами.