Анатолий

Поменяйте также id у второй формы
<form id="form-order">

<?php
	$modules = R::findAll('modules', 'id = ?');
	$lessons = R::findAll('lessons', 'module_id = ?');
  
	foreach ($modules as $module) {
		foreach ($lessons as $lesson) {
			if ( $lesson->module_id == $module->id ) {
				echo '
				<p>Модуль №', ++$i,' | ', $module->name,'</p>
				<p>Урок: ', $lesson->name, '</p><br/>
				';
			}
		}
	}
?>

Конечно FanatPHP прав и данную задачу лучше решать примерно так:

select
  m.name as `module`,
  l.name as `lesson`
from modules m
left join lessons l ON l.module_id = m.id
where l.id is not null

Но к сожалению с Redbean я не работал, так что перепишите запрос сами

Продумайте структуру с единой точкой входа, например:
www
-index.php
app
-core.php
-functions.php
-db.php
-footer.php
-header.php
-index
--i.php
--conf.php

В index.php подрубайте core.php в котором реализуйте роутинг
require_once ( "../app/core.php" );

// пример роутинга
if ( file_exists("../app/".$module."/conf.php") ) {
   require_once ( $module."/conf.php" );
   require_once ( "header.php" );
   require_once ( $module."/i.php" );
   require_once ( "footer.php" );
} else {
   require_once ( "404/i.php" );
}

Как-то так:

buy.on('click', function() {
    // При нажатии на кнопку складываются значения
    let productPrice = +buy.attr('data-price');
    let productCount = +$('#input').val();
    let oldSum = +cartPrice.text();
    let oldCount = +cartCount.text();
    cartPrice.text(oldSum+productPrice*productCount);
    cartCount.text(oldCount+productCount);
  })

В цикле foreach делайте проверку - равен ли $elem[id] айдишнику выбранного города, если равен, то добавляйте атрибут selected="selected" в option.

foreach ($data as $elem) {
  $selected = ( $id == $elem[id] ? 'selected="selected"' : '' );
  $contentCity .= "<option $selected value=\"$elem[id]\">$elem[city]</option>";
}