Ваш вопрос касается вообще любого сайта на php. Именно поэтому php тут выглядит костылем.
Сам процесс подсказывает, что ваша верстка и есть тема сайта, туда бы только переменные загнать и сделать циклы на js как это умеет делать pug. Увы, пока еще не наработано популярности в этом процессе. Верстка и перенос на движек продолжает быть раздельным процессом.
