Albert-turing

Excel, google документы. Или если уж наглядно нужно, то дома досточку с целями (фотографии целей) сделать или схему рисовать. Это чтобы уже каждый день видеть это на столе и стимулировать себя что-то делать :)

Лучшее решение для вас будет то к чему вы привыкнете. Серьезно, не тратьте время на поиск идеальных инструментов, проищите полжизни. Обозначьте цели, если хотите нарисуйте простую схему по типу "я хочу получить то-то и то" и подберите хорошее решение под эти задачи.
Выработаете методику потом будет виднее как её изменять. Непример, я веду список проектов в виде mindmap онлайн ветвистая структура упорядочивает все хорошо, а список задач в todoist.
Самые оперативные задачи записываю просто на бумажку и вычеркиваю. Не особо логичная система, но работает.

Хочу на GTD переползти.

Нравится - берите. Всегда можно поставить в него SSD (если его там еще нет, существенно ускоряет работу всех инструментов для сборки и вообще отзывчивость файловой системы, не представляю себе жизнь без SSD), минимум гигов 4 оперативки (что бы не уходила система в свап когда у вас открыты кучи вкладок в браузере, IDE, какие-либо средства разработки и т.д.) а лучше 8 (благо это сейчас не проблема вовсе). Процессор... больше ядер больше счастья. Если там будет какой core5 то за глаза хватит.