Andreas Shopen

Потому, что Вы сравниваете не элементы массива, а ссылки на объекты. А так как это разные объекты, то и ссылки будут отличаться. Если хотите поэлементно сравнить массивы, то используйте другие способы.

в JavaScript массивы являются объектами. Метод get_arr возвращает вам каждый раз новый объект. Когда вы сравниваете массивы через ==, то сравниваются ссылки на объекты, а они, как я сказал выше, разные. Есть простые способы сравнить массивы приводя их к строке:

get_arr().toString() == get_arr().toString()

Или:

JSON.stringify(get_arr()) == JSON.stringify(get_arr())

В тоже время если ваши массивы будут реально ссылаться на один и тот же объект, то при сравнении вы получите true:

var arr1 = get_arr();
var arr2 = arr1;
arr1 == arr2 // true

Так же можно найти различия в массивах, для этого удобно использовать библиотеку lodash, метод difference - https://lodash.com/docs/4.17.4#difference

const fillArray = count => 
  (new Array(count)).fill(1).map((item, i) => i + 1)

const fooBar = array =>
  array.map(number => 
    !(number % 3) && !(number % 5) 
    ? "FooBar"
    : !(number % 3) ? "Foo"
    : !(number % 5) ? "Bar" : number
  )

fooBar(fillArray(100))