Ну, гадать можно долго, но из описанного вами рекомендую проверить разделы реестра где указан (или в вашем случае возможно не указан) браузер по умолчанию, ищется в гугле, справитесь. В самом крайнем случае, ещё раз переустановить начисто и восстанавливать нужные программы по одной, проверяя функциональность ссылок через каждые пару восстановленных программ.