Итого, чтобы добавить SPI порт нужно сделать следующее:
- поправить в том или ином виде DTS файлы согласно примеру
https://github.com/osuosl/fedpkg-kernel/blob/maste... или любому другому;
- обязательно включить Device drivers->SPI support->User mode SPI driver support - нигде не написано, что нужно включать кроме McSPI driver for OMAP еще и этот;
- SPI0 - обозначается как spidev1.
В общем отлично работает после этих изменений.