в свойства стека добавить restart: always
запомните: docker-compose это просто средство стартовать докер-контейнеры, и на париться при этом указывая для каждого контейнера сети, линки и маппинги. после того как вы докер-композом один раз запустите стэк, параметры контейнеров будут сохранены и они будут стартовать вместе с докером (restart: always).