Новые/старые модули, насколько я понимаю, руками. У меня ни разу не было нужды откатываться, но всегда можно скачать на диск старую версию перед ей обновлением (через админку). Это уровень системы.
Шаблоны (стили, JS/PHP скрипты, даже TS скрипты) — если в системе контроля версий, то туда-сюда — не проблема. Данные операции — вотчина разработчиков сайта (веб-программистов, верстальщиков).
Страницы — в typo3 есть workspaces, насколько они позволяют откатываться — не знаю, но вроде позволяют. И это вроде бы задачи контент-менеджера.
Это из разной области задачи, поэтому единого средства управления нет.