.swiper-container по умолчанию overflow: hidden, иначе торчали бы лишние слайды. Если хотите тени внутри слайдов, заверните их содержимое в обёртку, перенесите на неё тень, а самому слайду добавьте паддинги по размеру тени. При необходимости можно это скомпенсировать маргинами у самого .swiper-container.