irfan viewer - под windows лучшая из бесплатных утилит по работе с изображениями, есть пакетная обработка, можно сразу куче файлов изменить размер/формат/степень сжатия и т.п.
не совсем уверен про условия фильтрации (например менять только тем изображениям у кого размер большой) но можно вручную, когда выделяешь файлы, отсортировать их по размеру и выбрать только верхние
если готовы из командной строки или програмку написать - то imagemagic