В CentOS очень старая версия ImageMagick, не исключено, что проблемы именно из-за этого. Браузер - не показатель, так как движок SVG у него свой. В Win8 наверняка версия новее - сравните версии программ.
Выхода два.
* Найти RPM-ку с обновлённой версией ImageMagick под CentOS или скомпилировать последнюю версию вручную. С виртуальным хостингом, правда, не сработает - вам просто не дадут обновить софт на сервере.
* Задействовать другую программу, поддерживающую SVG, например, Inkscape.
P. S. Ну и SVG на 5 мегабайт - это перебор. Если у вас виртуальный/выделенный сервер - может быть такое, что ему просто не хватило памяти. Понаблюдайте за процессом конвертации в top, если возможно.