Конечно можно. Если отдельный раздел, то при установке монтируйте в /home но не форматируйте. Только потом могут быть проблемы с конфигами прог, т.к. скорее всего разные версии. По этому лучше под /home сделать новый раздел, нужное переместить, а старый потом удалить и место отдать другому разделу. А что касается пакетов, так
кликайте тут
Потом на новой системе выберите из этого списка нужное и одной командой установите. Не забывайте про репозитории! Они сами не добавлятся, а я на 100% уверен, что у вас не все программы из официальных репов