Как пофиксить внезапную ошибку 2002 (HY000) mysql — mariadb под Mac OS Big Sur?

Question

[lagudal]

Дано - локальный сервер, под Mac OS Big Sur, nginx, mariadb, php-fpm, все устанавливалось с homebrew.
Установлено и работает давно, с весны с первых карантинных дней, последний раз обновлялось все в октябре после обновления системы до Big Sur. До сегодняшнего дня все работало как часы, сегодня с утра открываю в браузере и получаю ошибку:

PDOException: SQLSTATE[HY000] [2002] No such file or directory in /usr/local/.....

Пытаюсь зайти через консоль -
mysql -u root -p
в ответ получаю:

ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock' (2)

При этом

@Alexanders-MacBook-Pro var % mysqladmin -u root -p status
Enter password: 
mysqladmin: connect to server at 'localhost' failed
error: 'Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock' (2)'
Check that mysqld is running and that the socket: '/tmp/mysql.sock' exists!

Проверяю

@Alexanders-MacBook-Pro /tmp % mysqld --help --verbose | grep sock

Ответ

socket                                                       /tmp/mysql.sock
unix-socket                                                  ON

По гуглу прошел, но пока ничего не помогло, вот последний подобный вопрос на stackoverflow совсем недавно, как видно пока без решения.
Проблема похоже один к одному, но там у человека после апдейта, а у меня ничего вчера не обновлялось, по крайней мере вручную точно ничего не обновлял.
Сносить и заново ставить mysql не очень хочется..

Answer 1

[Vitaly Karasik]

попробуйте перестартовать, или для начала проверить бежит ли

brew services status mysql

потом stop / start

Comments

[lagudal]

brew services status mysql

Error: Invalid usage: unknown subcommand: status
вообще то вроде как brew services list -

@Alexanders-MacBook-Pro bin % brew services list         
Name    Status  User            Plist
mariadb started alexander /Users/alexander/Library/LaunchAgents/homebrew.mxcl.mariadb.plist
nginx   started alexander/Users/alexandernaumov/Library/LaunchAgents/homebrew.mxcl.nginx.plist
php@7.2 started alexander /Users/alexander/Library/LaunchAgents/[e-mail]

стоп, старт, рестарт не помогают

[Vitaly Karasik]

а что в logfile ?

[lagudal]

честно говоря я не нашел где логи от mariadb тут хранятся - есть в домашней директории ~/Library/Logs/Homebrew/mariadb - но там девственно чисто.
Еще нашел по /usr/local/var/mysql/ -там пару файлов вида username.local.err и username.label.intern.err - но там тоже не отображены никакие сегодняшние ошибки...

[Vitaly Karasik]

Еще нашел по /usr/local/var/mysql/

- а когда последние сообщения?
Можно попробовать остановить сервисе и запустить mysqld вручную - может в консоли что-то увидим.

Можно попробовать подключиться через TCP/IP - 'mysql -h localhost'.

[lagudal]

- а когда последние сообщения?

Сегодня вижу что там лог заполняется каждые 10 секунд, но не вижу там ничего по поводу сокетов.

2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Uses event mutexes
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.11
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Number of pools: 1
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Using crc32 + pclmulqdq instructions
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Initializing buffer pool, total size = 134217728, chunk size = 134217728
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Completed initialization of buffer pool
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Starting crash recovery from checkpoint LSN=348758843,348758843
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store1.ibd' with space ID 11400, since the redo log references ./magento/catalog_category_product_index_store1.ibd with space ID 10408.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store2.ibd' with space ID 11401, since the redo log references ./magento/catalog_category_product_index_store2.ibd with space ID 10409.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_product_index_eav.ibd' with space ID 11405, since the redo log references ./magento/catalog_product_index_eav.ibd with space ID 10413.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/cataloginventory_stock_status.ibd' with space ID 11407, since the redo log references ./magento/cataloginventory_stock_status.ibd with space ID 10415.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_product_index_price.ibd' with space ID 11408, since the redo log references ./magento/catalog_product_index_price.ibd with space ID 10416.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalogsearch_fulltext_scope1.ibd' with space ID 11409, since the redo log references ./magento/catalogsearch_fulltext_scope1.ibd with space ID 10417.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalogsearch_fulltext_scope2.ibd' with space ID 11421, since the redo log references ./magento/catalogsearch_fulltext_scope2.ibd with space ID 10429.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento233/design_config_grid_flat.ibd' with space ID 11433, since the redo log references ./magento233/design_config_grid_flat.ibd with space ID 11050.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento233/customer_grid_flat.ibd' with space ID 11445, since the redo log references ./magento233/customer_grid_flat.ibd with space ID 11062.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/design_config_grid_flat.ibd' with space ID 11376, since the redo log references ./magento/design_config_grid_flat.ibd with space ID 11270.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/customer_grid_flat.ibd' with space ID 11388, since the redo log references ./magento/customer_grid_flat.ibd with space ID 11282.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/design_config_grid_flat.ibd' with space ID 11376, since the redo log references ./magento/design_config_grid_flat.ibd with space ID 11295.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/customer_grid_flat.ibd' with space ID 11388, since the redo log references ./magento/customer_grid_flat.ibd with space ID 11307.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/design_config_grid_flat.ibd' with space ID 11376, since the redo log references ./magento/design_config_grid_flat.ibd with space ID 11319.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/customer_grid_flat.ibd' with space ID 11388, since the redo log references ./magento/customer_grid_flat.ibd with space ID 11331.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store1_replica.ibd' with space ID 11343, since the redo log references ./magento/catalog_category_product_index_store1_replica.ibd with space ID 10297.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store2_replica.ibd' with space ID 11344, since the redo log references ./magento/catalog_category_product_index_store2_replica.ibd with space ID 10298.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store1.ibd' with space ID 11343. Another data file called ./magento/catalog_category_product_index_store1_replica.ibd exists with the same space ID.
2021-01-28 10:35:51 0 [ERROR] InnoDB: Cannot rename './magento/catalog_category_product_index_store1_replica.ibd' to './magento/catalog_category_product_index_store1.ibd' because the target file exists. Remove the target file and try again.
2021-01-28 10:35:51 0 [ERROR] InnoDB:  Cannot replay file rename. Remove either file and try again.
2021-01-28 10:35:51 0 [ERROR] InnoDB: Plugin initialization aborted with error Generic error
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] InnoDB: Starting shutdown...
2021-01-28 10:35:51 0 [ERROR] Plugin 'InnoDB' init function returned error.
2021-01-28 10:35:51 0 [ERROR] Plugin 'InnoDB' registration as a STORAGE ENGINE failed.
2021-01-28 10:35:51 0 [Note] Plugin 'FEEDBACK' is disabled.
2021-01-28 10:35:51 0 [ERROR] Unknown/unsupported storage engine: InnoDB
2021-01-28 10:35:51 0 [ERROR] Aborting

[lagudal]

mysql -h localhost

ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock' (38)

Можно попробовать остановить сервисе и запустить mysqld вручную - может в консоли что-то увидим

если от пользователя пробую запустить

@Alexanders-MacBook-Pro mysql % mysqld
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] mysqld (mysqld 10.5.8-MariaDB) starting as process 67507 ...
2021-01-28 10:15:04 0 [Warning] Setting lower_case_table_names=2 because file system for /usr/local/var/mysql/ is case insensitive
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Uses event mutexes
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Compressed tables use zlib 1.2.11
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Number of pools: 1
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Using crc32 + pclmulqdq instructions
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Initializing buffer pool, total size = 134217728, chunk size = 134217728
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Completed initialization of buffer pool
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Starting crash recovery from checkpoint LSN=348758843,348758843
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store1.ibd' with space ID 11400, since the redo log references ./magento/catalog_category_product_index_store1.ibd with space ID 10408.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store2.ibd' with space ID 11401, since the redo log references ./magento/catalog_category_product_index_store2.ibd with space ID 10409.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_product_index_eav.ibd' with space ID 11405, since the redo log references ./magento/catalog_product_index_eav.ibd with space ID 10413.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/cataloginventory_stock_status.ibd' with space ID 11407, since the redo log references ./magento/cataloginventory_stock_status.ibd with space ID 10415.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_product_index_price.ibd' with space ID 11408, since the redo log references ./magento/catalog_product_index_price.ibd with space ID 10416.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalogsearch_fulltext_scope1.ibd' with space ID 11409, since the redo log references ./magento/catalogsearch_fulltext_scope1.ibd with space ID 10417.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalogsearch_fulltext_scope2.ibd' with space ID 11421, since the redo log references ./magento/catalogsearch_fulltext_scope2.ibd with space ID 10429.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento233/design_config_grid_flat.ibd' with space ID 11433, since the redo log references ./magento233/design_config_grid_flat.ibd with space ID 11050.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento233/customer_grid_flat.ibd' with space ID 11445, since the redo log references ./magento233/customer_grid_flat.ibd with space ID 11062.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/design_config_grid_flat.ibd' with space ID 11376, since the redo log references ./magento/design_config_grid_flat.ibd with space ID 11270.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/customer_grid_flat.ibd' with space ID 11388, since the redo log references ./magento/customer_grid_flat.ibd with space ID 11282.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/design_config_grid_flat.ibd' with space ID 11376, since the redo log references ./magento/design_config_grid_flat.ibd with space ID 11295.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/customer_grid_flat.ibd' with space ID 11388, since the redo log references ./magento/customer_grid_flat.ibd with space ID 11307.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/design_config_grid_flat.ibd' with space ID 11376, since the redo log references ./magento/design_config_grid_flat.ibd with space ID 11319.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/customer_grid_flat.ibd' with space ID 11388, since the redo log references ./magento/customer_grid_flat.ibd with space ID 11331.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store1_replica.ibd' with space ID 11343, since the redo log references ./magento/catalog_category_product_index_store1_replica.ibd with space ID 10297.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store2_replica.ibd' with space ID 11344, since the redo log references ./magento/catalog_category_product_index_store2_replica.ibd with space ID 10298.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Ignoring data file './magento/catalog_category_product_index_store1.ibd' with space ID 11343. Another data file called ./magento/catalog_category_product_index_store1_replica.ibd exists with the same space ID.
2021-01-28 10:15:04 0 [ERROR] InnoDB: Cannot rename './magento/catalog_category_product_index_store1_replica.ibd' to './magento/catalog_category_product_index_store1.ibd' because the target file exists. Remove the target file and try again.
2021-01-28 10:15:04 0 [ERROR] InnoDB:  Cannot replay file rename. Remove either file and try again.
2021-01-28 10:15:04 0 [ERROR] InnoDB: Plugin initialization aborted with error Generic error
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] InnoDB: Starting shutdown...
2021-01-28 10:15:04 0 [ERROR] Plugin 'InnoDB' init function returned error.
2021-01-28 10:15:04 0 [ERROR] Plugin 'InnoDB' registration as a STORAGE ENGINE failed.
2021-01-28 10:15:04 0 [Note] Plugin 'FEEDBACK' is disabled.
2021-01-28 10:15:04 0 [ERROR] Unknown/unsupported storage engine: InnoDB
2021-01-28 10:15:04 0 [ERROR] Aborting

Если от root

sh-3.2# mysqld
2021-01-28 10:15:14 0 [Note] mysqld (mysqld 10.5.8-MariaDB) starting as process 67509 ...
2021-01-28 10:15:14 0 [Warning] Setting lower_case_table_names=2 because file system for /usr/local/var/mysql/ is case insensitive
mysqld: Please consult the Knowledge Base to find out how to run mysqld as root!
2021-01-28 10:15:14 0 [ERROR] Aborting

это когда brew services stop mariadb
Очевидно что сервер не запускается, поскольку если я запускаю сервис -
brew services start mariadb
независимо, от пользователя или от рута, несмотря на то что в списке написано -
@Alexanders-MacBook-Pro mysql % brew services list

Name Status User Plist
mariadb started alexander /Users/alexander/Library/LaunchAgents/homebrew.mxcl.mariadb.plist

в реальности сервер не запущен. Монитор его не видит, хотя должен.
Nginx, php-fpm процессы видит, а mysqld, или mysql или mariadb процесса в мониторе нет.

[Vitaly Karasik]

lagudal, Это примерно то что я предполагал - сервер вообще не стартует.
Что-то случилось с файлами базы - может их стерли или переименовали директорию?
Что делать? - зависит от того важна ли вам ваша старая база. Если нет - удалить и установить заново mysql, или запустить 'mysqld --initialize' https://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/server-opt... . Если важна - разбираться что произошло с директорией 'magento'.

[lagudal]

еще предлагают запустить сервер -
mysql.server start
в этом случае

@Alexanders-MacBook-Pro mysql %  mysql.server start 
Starting MariaDB
.210128 11:14:59 mysqld_safe Logging to '/usr/local/var/mysql/Alexanders-MacBook-Pro.local.err'.
210128 11:14:59 mysqld_safe Starting mariadbd daemon with databases from /usr/local/var/mysql
/usr/local/bin/mysql.server: line 264: kill: (90121) - No such process
 ERROR!

В логе то же самое что я привет выше.
Если я правильно понимаю лог, я запускаю сервер, но на каком то этапе error и aborting.
Если я запускаю штатно сервис - brew services start mariadb - попытка запуска повторяется каждые 10 секунд.
Похоже, что с правами что то не так?

2021-01-28 11:18:06 0 [ERROR] InnoDB: Cannot rename './magento/catalog_category_product_index_store1_replica.ibd' to './magento/catalog_category_product_index_store1.ibd' because the target file exists. Remove the target file and try again.
2021-01-28 11:18:06 0 [ERROR] InnoDB:  Cannot replay file rename. Remove either file and try again.
2021-01-28 11:18:06 0 [ERROR] InnoDB: Plugin initialization aborted with error Generic error
2021-01-28 11:18:06 0 [Note] InnoDB: Starting shutdown...
2021-01-28 11:18:06 0 [ERROR] Plugin 'InnoDB' init function returned error.
2021-01-28 11:18:06 0 [ERROR] Plugin 'InnoDB' registration as a STORAGE ENGINE failed.
2021-01-28 11:18:06 0 [Note] Plugin 'FEEDBACK' is disabled.
2021-01-28 11:18:06 0 [ERROR] Unknown/unsupported storage engine: InnoDB
2021-01-28 11:18:06 0 [ERROR] Aborting

[Vitaly Karasik]

lagudal, все эти команды делают одно и то же, так что результат одинаковый.
Как я написал, или что-то случилось с файлами (удалили, переименовали), или патчи MacOS поломали права.

[lagudal]

Что-то случилось с файлами базы - может их стерли или переименовали директорию?
Что делать? - зависит от того важна ли вам ваша старая база. Если нет - удалить и установить заново mysql, или запустить 'mysqld --initialize' https://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/server-opt... . Если важна - разбираться что произошло с директорией 'magento'.

вот эта база не очень важна, в принципе, можно обойтись без нее. Но рядом есть важная, ее потерять не хотелось бы, свежего бекапа как всегда нет.

Что же там могло случится с этой базой, я там точно ничего не трогал и не переименовывал. Разве что на физическом уровне что то..

[lagudal]

Как я написал, или что-то случилось с файлами (удалили, переименовали), или патчи MacOS поломали права.

вот я тоже на права думаю - сейчас у меня на /usr/local/var/mysql рекурсивно user: admin
Даже не знаю, как должно быть.

[lagudal]

Удалось сервер запустить - добавил в my.cnf

[mysqld]
innodb_force_recovery = 1

т.е. сервер запускается игнорируя ошибки - в логе видны эти ошибки, и сайт с базой magento стартует с ошибками.
Похоже, база как то побилась, но теперь легче ремонтировать, когда есть доступ.
Но самое главное, нужная база практически не пострадала - хотя там видно что тоже не без проблем.