На любое блочное устройство (флешку, в том числе) Линукс ставится штатным инсталлятором соответствующего дистрибутива. Точно так же, как и на HDD/SDD.
Если не хочется загружаться с установочного образа и прерываться от обычной повседневной работы в основной системе, то
Debootstrap в помощь.