в настройках компонента должно быть поле связанное с первой сортировкой и второй сортировкой, если компонент именно на вывод разделов подключен вне комплексного.
иначе надо смотреть глубже, где описывается метод CNextCache::CIBlockSection_GetList, возможно получится
CNextCache::CIBlockSection_GetList(array('SORT' => array('NAME' => 'ASC'), 'CACHE' => array("MUL.....
а возможно не получится, все зависит от метода
в крайнем можно отсортировать массив перед выводом через usort, но это уже костыль, хотя и рабочий вариант