По вашим вопросам
1) Вы можете прописать хоть 22 А-записи.
2) Проканает, если под этим вы подразумеваете, что клиент будет получать пул адресов
3) RR DNS далеко не самый лучший вариант распределения нагрузки. Правильнее было бы раскидывать клиентов через балансировщик. И не забывайте про сессии. Весьма неприятны ситуации, когда я залогинен на сервере в Токио, а при следующем запросе получаю адрес сервера в Торонто, который еще не успел получить мои сессионные данные.
Самое негативное последствие, помимо описанного выше, может быть в том, что у вас отвалится сервер приложений, а NS-сервера будут отдавать клиентам его адрес.
P.S. Если соберетесь таки делать "синхронизацию файлов" советую присмотреться к этой реализации DFS
www.leofs.org