Рекомендую погуглить bgp troubleshooting guide, там много техник и причин. Встречал проблемы с MTU, со слишком большой таблицей при full update (забивала канал), с блокировкой на файрволах, с неправильно выставленными таймерами bfd, с дропами из-за перегрузки каналов (красить сигнальный трафик надо), с некорректной маршрутизацией именно bgp трафика...