Если есть под рукой загрузочный диск с Windows, то можно попробовать решить проблему через консоль восстановления прежде чем разворачивать бекап:
- загружаетесь с диска, переходите в консоль восстановления
- открываете консоль
- запускаете fixboot (восстанавливает менеджер загрузки)
- запускаете fixmbr (восстанавливает загрузочный сектор на ЖД)
Есть еще более мощная утилита
bootrec
По этому
вопросу масса информации в интернете.