Есть ли риск потери данных
Не слышал особо про fscrypt, но использовал LUKS, мне он показался очень убогим (чувствительным к отключению питания). Отключилось электричество во время записи - потерял всё на разделе.
сильно ли замедляется работа компа?
Нет, сейчас в процессорах на аппаратном уровне поддерживается алгоритм шифрования AES, тормозов быть не должно, если будете использовать этот алгоритм.