их и не нужно связывать. web-socket сервер должен быть как stand-alone приложение. Вам нужно организовать связь между ним и приложением на yii (через rest, сокеты или RabbitMQ/ZeroMQ).
А вообще в вашем случае, как мне кажется, проще использовать сервисы типа
pusher.