Раз в, примерно, 20 минут на сайт заходит бот Яндекса чтобы скачать свежие прайс-листы или убедиться в том, что они не изменились. Как правило операция завершается успешно, но раз в сутки (время меняется, чаще по ночам) ему не удается получить ответ от сервера за отведенные 150 секунд и он отключается с ошибкой 408 Request Timeout. Причем как правило такие неудачные попытки случаются по две подряд.
В логах nginx при этом в соответствующее ошибкам в админке Маркета время ответ формируется нормально, занимает максимум 30 секунд если архив с прайс-листами не закэширован (пробовал отключить кэширование для директории с прайсами, не помогло), в случае если код ответа 304 -- сервер отвечает моментально.
При этом о том, что какая-то проблема действительно есть, сигнализирует то, что время неудавшейся загрузки в админке бывает на минуту-две раньше, чем время ответа nginx в логах, т.е. видимо что-то серьезно задерживает ответ.
Нагрузка на сервер в те моменты, когда это происходит, обычная (согласно ISPManager), и в целом в течение дня достаточно низкая, перебоев в работе самого сайта тоже нет.
Как это можно дебажить, куда копать?
Настройки nginx, которые могут быть релевантны:
proxy_read_timeout 1600;
proxy_send_timeout 1600;
proxy_connect_timeout 1600;
keepalive_timeout 150;
client_body_timeout 150;
client_header_timeout 150;
Также пробовал следующее, не помогло:
send_timeout 1600;
fastcgi_read_timeout 1600;
proxy_max_temp_file_size 2048m;
proxy_buffers 16 16k;
proxy_buffer_size 16k;