вы привели не весь конфиг, скорее всего у вас что-то типа такого:
location / {
try_files $uri /index.php?$args;
}
Это ходовая практика -- направлять ВСЕ запросы на одну точку входа, дальше уже разбирая в приложении.
Если у вас есть некоторые другие пожелания, то добавьте новое правило выше данного, но такое пригождается крайне редко
Если нужны некоторые пути, то можете как-то так сделать:
location / {
try_files $uri @rewrite;
}
location @rewrite {
rewrite ^/first/?$ first.php;
rewrite ^/second/?$ second.php;
rewrite ^ /index.php;
}