просто создаешь свой класс с нужными свойствами и прописываешь. Только учти, приоритет наследования задается не только "более поздним" переопределением класса.
например: .container > .button будет всегда иметь больший вес, чем просто .button, в каком бы порядке ты их не определял. Почитай про вес классов.
Соотв. чтобы заработало переопределение, нажимаешь F12 и смотришь, как задан стиль для нужного тебе объекта. Задаешь своему классу аналогичный вес и все работает.
Вот пример, каждый из переопределенных вариантов работает. Или же, если позволяет ситуация, можно в классах не указывать какой-то из бутстраповских классов, чтобы уменьшить стандартный вес
https://jsfiddle.net/hasalex/dtgwxs07/11/