Однозначно заводить баги отдельно от стори, но линковать их с исходной задачей для трекинга статуса. Как вариант - делать подзадачи, если система такое позволяет, если вам не нравится идея закрывать сторю с непофикшенными багами :)
Если просто возвращать стори с комментариями, то сложно оценить беглым взглядом, насколько же там все плохо.
Сложно трекать, что пофикшено, а что - нет.
Информация по багам может теряться.
В принципе не очень ясен статус такой стори.
В общем, на борде очень скоро наступит неразбериха, а стендапы могут быть в стиле
- Почему стори не двигается?
- Баг все еще чиним!
- Который?
- Ну который там в 7 и 13 и 15 комментах был описан..
- Эээ.. (открывает комменты, читает, пытается понять).. Про что там?
- Ну про [вот эту ерунду]
- А, ок!
А если баги отдельно:
- Почему эту стори не подвинули?
- Чиним баг WTF-512
- Так, "Не работает [вот эта ерунда]".. а, понятно!