А если это реализовать на уровне запроса?
INSERT INTO new_db.new_table (field1,field2)
SELECT data1 AS field1, data2+data3 AS field2 FROM old_db.old_table;
Если обе базы на одном сервере.
Время затраты как при копировании файлов так как данные сразу получаются и сразу пишутся на диск.