Дока там печальная, попробуйте так:
1. выделите кусок верстки в отдельный menu.tpl
2. на беке, где включается основной .tpl, делать проверку по относительному урлу, что это главная страница
if($_SERVER['REQUEST_URI'] == '/') {
$menu = file_get_contents('path/to/your/menu.tpl');
}
3. Выводить $menu как переменную в том .tpl шаблоне, что вам надо.
Может есть более красивое решение (menu.tpl можно нормально подключить), но я с okaycms не работала.
А может Вы засунули меню в index.tpl, а надо в main.tpl?
дока