Сразу скажу что поддержка хостинга внятных ответов не дает, говорит что БД все это занимает!
Имеем:
VPS с операционной системой Centos
Дисковое пространство 280 Гб
На нем всего одна база данных, но около 230 Гб вместо со всеми индексами и таблицами.
Скрипт для работы с БД весит всего 1 мб. Больше ничего нет, ни сайтов ни картинок ни других файлов. Только БД. Логи почищены.
А свободного места показывает всего 20 Гб, куда делись еще 30 гб? памяти. Ну понимаю там сама операционка сколько то весит, какие то системные файлы. команда du находит только каталог /var/lib/mysql/ общий вес папки с базами данных 229 Гб. Других крупных директорий не обнаружено