К сожалению вы можете сделать эти действия по отдельности, но не последовательно.
открыть ссылку:
chrome https://ya.ru
открыть пустую страницу и запустить java скрипт (на самом деле открыть страницу, закодированную в ссылке через data uri):
chrome "data:text/html;charset=utf-8;base64,PHNjcmlwdD5hbGVydCgxKTwvc2NyaXB0Pg=="
вместо chrome можно использовать firefox, по умолчанию data uri в системе не зарегистрированы, а значит воспользоваться
start ссылка
получится только для стандартных http/ftp ссылок