В смысле? Как PHP должен понять что вы там на Фронтенде накликали??! Для чекбоксов используете объект JavaScript и сохраняете в этот объект ID тех записей которые отмечены чекбоксом. После ассинхронным запросом передаете сериализованный объект в PHP, через POST, так как в GET может что то не влезть, будете "мучаться" потом, разбираясь в основах http.