 
  
  $text = 'СЧЕТУ 555 ОТ 01.01.2019, счету 556 ОТ 01.01.2019';
preg_match_all('/счету\s(\d+)\s/ui', $text, $matches);
print(implode(', ', $matches[1])); 
  
  //d{3,6} -  здесь указываешь  от скольки до скольки цифр бывает в номере счета.
        preg_match_all('/\s(\d{3,6})\s/', 'СЧЕТУ 555 ОТ 01.01.2019, счету 556 ОТ 01.01.2019"', $matches);
       $matches = $matches ? implode(',' , $matches[1]) : '';
        print_r($matches);