Нужно этот код применить после клика по этой же ссылке, вот код:
$(".filter-category li a").on("click", function(e){
$("html, body").stop().animate({
scrollTop: $("#menu").offset().top
}, 500);
});
То есть, я кликаю по .filter-category li a - идет перезагрузка страницы и потом должен срабатывать этот код