Любая из инструментально-восстановительных сборок Win-PE подойдёт (возможно, даже старинный hiren`s boot CD сгодится), если в ней найдётся любой интернет-браузер. В нём открываете
веб-версию Скайпа, и там вызываете проверочную службу Echo / Sound Test Service. В предложенные 10 секунд наговариваете что-то в ваш микрофон, затем прослушиваете и делаете выводы.
Я всегда так микрофоны проверяю (правда, на стационарной версии Скайпа).