Сложность в том, что темы в репозитории заскришочены в лучшие моменты их жизни :) Когда установлен и раскидан общий набор плагинов, виджетов и прочей атрибутики. Иногда для правильного функционирования темы нужны дополнительные элементы. Иногда представлена отдельная статичная страница.
Настройка темы доступна:
1. На отдельной странице через настройщик темы (есть не всегда и не во всех темах)
2. Через стандартную настройку темы WP
3. Руками, что обычно сложнее и не всегда выходит.