Что-то мне подсказывает, что это задача не из лёгких, но всё же: могут ли вредоносные программы вносить изменения в Системный журнал Windows? Скажем, подчищать свою активность, удалять и редактировать записи.
Тут несколько моментов:
1.Если вредоносная программа работает с правами локального админа или системы то может, конечно.
2.Через интерфейс винды системные журналы можно только очистить. Есть ли возможность в API выполнять удаление отдельных события я не в курсе. Если есть, то вирусы это могут делать, если нет ... то тоже могут :-), но уже гораздо сложнее.