Подозреваю, что базы данных никакой нет (она конечно же есть, но вам в нее не нужно), а лимиты реализованы через квотирование дискового пространства.
Вот здесь почитайте - https://www.opennet.ru/base/sys/linux_fs_quota.txt.html
А посмотреть можно и через консоль repquota -ua