3000-5000 в день? это вообще не нагрузка.
3000-5000 одномоментно? это нужно полностью архитектуру под скорость пилить, если вы хотите гарантий производительности. это
вам к квалифицированному программисту следует обратиться. он посмотрит внутрь и скажет/переделает.
общие советы тут не помогут.
вот тут только общие аспекты в статье рассказаны - а уже целая статья
Из говнокода в Highload. Используем ТАРАНtool. 5 р...
в кратком ответе ну никак не ответить.
для начала я бы предложил профилировать для выяснения - а
где же именно тормозит.
при условии что до этого весь треш, подобный описанному в статье уже вычищен.