Из JS в PHP:
Через jQuery фреймворк и
плагин
$.cookie('var_name', 'value', { expires: 10, path: '/', domain: 'mydomain.ru', secure: false, });
echo $_COOKIE['var_name'];
Из PHP в JS:
setcookie('var_name', 'value');
console.log($.cookie('var_name'));
Подробнее о PHP куках
тут.