Нужно не удалять (это равнозначно тому, что они в секции require-dev) — тк тогда опять gii и debug не встанут и класс также не будет найден, значит нам н
ужно их перенести в секцию require в файле composer.json
Инструкция от разраба Yii2

Или вариант 2, как подметил
OKyJIucT — нужно удалить код с использованием этих классов в коде проекта