А что именно у Вас "не получилось"? Если сделать так, чтобы исходный скрипт перестал работать — так это естественно, он при загрузке страницы интерпретируется, записывается в память и работает оттуда, так что можете хоть сто раз его в коде страницы переписать, ему от этого уже ни жарко ни холодно.
А на страницу Ваш скрипт и так добавляется, в смысле что код, вызываемый из Tampermonkey, не надо никуда в тэг script на странице записывать. Он и так будет работать, главное, чтобы в самом скрипте какая-то работа происходила.
Что именно Вам нужно заменить, напишите. Какие действия.