Разобрался. Нужно использовать опцию Coordinate Transformation Matrix.
И даже написал калибровочный сервис:
1. Сначала нужно установить для устройства матрицу 1 0 0 0 1 0 0 0 1 (она задается по-умолчанию).
2. Потом открываете
https://advanty.ru/calib/ и разворачиваете на весь экран (F11).
3. Следуете указаниям: тыкаете по уголкам.
4. Копируете строку для проверки в терминал, заменяете DEVICE_NAME на нужное значение и запускаете. Тач должен начать правильно работать.
5. Если всё ок, то помещаете строку для xorg.conf.d в файл /usr/share/X11/xorg.conf.d/99-calibration.conf. Помимо этой строки нужно внести "обвязку":
Section "InputClass"
Identifier "calibration"
#Название продукта можно посмотреть с помощью команды xinput list
MatchProduct "My Super Puper Touchscree Inc."
#Ниже вставляем строку со страницы сайта
Option "TransformationMatrix" "1 0 0 0 1 0 0 0 1"
EndSection
6. Перезапускаете иксы (можно просто ребутнуться).
P.S. Я тестировал только в хроме.