Очевидно, что чем длиннее выдержка, тем больше вероятность, что объект успеет сдвинуться в кадре за время экспозиции (от ветра, от тряски самой камеры, даже если она стоит на штативе). Так что снимок оказывается смазан.
Также очевидно, что днем можно снимать не только с более короткой выдержкой, но и с меньшим значением чувствительности (ISO). Большее значение чувствительности всегда означает худшее отношение сигнал/шум. Даже если речь о "качественной" камере. Больший уровень шума всегда снижает субъективное ощущение четкости.
Ну и, не стоит забывать о том, что в темноте камере сложнее сфокусироваться, если используется автофокус, а потому она вполне может ухватиться совсем за другую часть сцены, чем это случилось днем. При съемке в темноте категорически рекомендую использовать предварительную фокусировку с подсветкой и функцию AF Lock, чтобы снимок уже без подсветки был с теми же настройками фокуса. Только разберитесь сначала, как это работает на вашей камере.