Чтобы получить файл читать в сторону smbclient.
Чтобы распарсить файл, нужно понимать для чего. Если для проекта на php то у нас удачный опыт использоваться phpexcel.codeplex.com/
Написать скриптик, использую найденную библиотеку для работы с документами экселя, который по крону дергает файлик и считывает с него то, что нужно. Или сохранять этот же файл еще и в csv/xml формат и пользоваться опять же самописным скриптиком
Вопрос с парсингом этого файла не стоит. Вопрос именно в том как забрать этот файл по крону или по другому.
На локальном компьютере понятно как это делать, а как это сделать Linux-ом, я не знаю.