Можете посмотреть на
Markdoc. Генератор статической документации из Markdown. Стили и шаблоны допиливаются. Использую
здесь (прикрутил bootstrap, доделал шаблоны для боковой навигации и ленты новостей). Исходники с доработками
здесь.
Раньше использовал
DokuWiki. Но это серверное приложение. Отказался в пользу статической документации на github pages.