мнээээ, наверное практически никогда. просто правильно настраивают.
нетфильтр компонент ядра, я не помню настроек menuconfig, там параметры нетфильтра были точно, но можно ли его исключить полностью хз.
Пользователь Мне нужно обосновать (в курсовой), почему я изобрел велосипед. А если, например, я собираюсь сделать коммерческую систему инспекции пакетов, могу ли я использовать Netfilter для перехвата пакетов?
Gentoo собирается из исходников, если нельзя выпилить стандартными средствами, есть вариант выпилить это руками. И не придётся мучаться со сборкой зависимостей и поддержкой их в актуальном состоянии, в отличии от LFS.