у меня примерно такая структура файлов:
_b // БЭМ компоненты
    _slider.scss
    _auth.scss
    _index.scss // все файлы ипортируются сюда
rewrite // перезапись сторонних библиотек
    _bootstrap.scss
    _select2.scss
    _index.scss // все файлы импортируются сюда
fonts // шрифты
    _roboto.scss
    _index.scss  // все файлы импортируются сюда
_helpers.scss // файл полезных фишечек
_normalize.scss
styles.scss // на этот файл смотрит gulp. Сюда включаются все файлы index.scss из папок и файлы хелпера и нормалайза.
В твоем случае: ты можешь указать импорт из вне:
@import '../../main.scss';
Только следи чтобы не зациклился импорт, gulp будет ругаться.