Пробегать по массиву нужно только если нужны сами элементы.
Зачем вам только индексы? Какую задачу вы пытаетесь решить?
и for..in не предназначен для массивов.
1. А что это за задача, когда только индекс нужен? Тут и перебора нафиг не надо, длина массива есть - поехали кататься циклом.
2. Делал сравнительные тесты в том же хроме - сейчас разницы особой уже нет в скорости обхода.